Esta Comisión, es el órgano encargado de dictar, mediante acuerdos, las regulaciones y lineamientos de carácter administrativo, orientadas a asegurar el adecuado funcionamiento del Sistema.

Los gobernadores que participan de la primera Cumbre de Gobernadores en Cartagena, eligieron al gobernador de Casanare, César Ortiz Zorro, como representante de los departamentos productores, ante la Comisión Rectora del Sistema General de Regalías.
En esta comisión recae la priorización de los proyectos de inversión financiados con recursos de Regalías para las regiones productoras y por ende, determina la distribución, objetivos, fines, administración, ejecución, control, el uso y la destinación de los ingresos provenientes de la explotación de los recursos naturales no renovables, precisando las condiciones de participación de sus beneficiarios.
Bajo el nuevo esquema de coordinación entre las entidades territoriales y el Gobierno Nacional, se determina la distribución y destinación de los ingresos provenientes de la explotación de los recursos naturales no renovables, precisando las condiciones de participación de sus beneficiarios.
De esta manera Casanare continúa liderando la representación de los mandatarios de las regiones productoras de hidrocarburos, pues, recordemos que el mandatario saliente Salomón Sanabria había logrado asiento en la máxima instancia de regulación del Sistema General de Regalías.